على الرغم من سمية زيت اللوز المر إلّا أنّ له العديد من الفوائد التي يمكن للإنسان الاستفادة منه في تحقيقها، ومنها:

* القضاء على الالتهابات والجراثيم والفيروسات والبكتيريا المسببة للأمراض.
* القضاء على الديدان المعوية ومحاربتها، وتسكين التشنجات المعوية.
* خفض درجة حرارة الجسم عند ارتفاعها.
* إدرار البول وعلاج الإمساك.
* تسكين الآلام وتخديرها عند استخدامه خارجياً على مواضع الألم، لذلك يمكن استخدامه لترطيب بشرة الأطفال.
* الحصول على بشرة نضرة وجميلة، حيث يعمل زيت اللوز المر على تغذية البشرة وترطيبها
* الوقاية من أضرار أشعة الشمس والتخفيف من تأثيرها وعلاج آثار الحروق التي تتركها والتقليل من احمرارها
ويساعد على توحيد لون البشرة والتخلص من البقع الداكنة.
* التخلص من الأوساخ والخلايا الميتة التي قد تتراكم على سطح البشرة وتسبب ظهور الحبوب فيها
لذلك يستخدم في تنظيف البشرة من آثار المكياج ومستحضرات التجميل.
* علاج مشكلة الهالات السوداء حول العينين من خلال تدليك المنطقة المصابة بالزيت وتركها لمدة دقيقتين ثم يتم مسحه بلطفٍ.
* علاج الأكزيما والصدفية التي تظهر على الجلد، فهو مرطب جيد للبشرة ويقلل من الحكة التي تصاحبها.
* علاج مرض داء الكلب، وذلك لأن داء الكلب ينتج بسبب نوعٍ من الفيروسات وعند تناول زيت اللوز المر فإنه يقتل هذا الفيروس بسبب سميته الشديدة